1938-1939 eğitim ve öğretim yılında İstanbul Üsküdar Lisesi Maarif Vekâleti tarafından 14. Kız Ortaokulu adıyla hizmete açılmıştır. İleriki yıllarda değişik adlar alarak günümüze kadar eğitim ve öğretim faaliyetini başarıyla sürdürmüştür.

1945-1946 eğitim ve öğretim yılına kadar ortaokul olarak kalan okul aynı yıl kız lisesine dönüştürülerek Üsküdar Kız Lisesi adını almıştır.

1949-1950 eğitim ve öğretim yılında kız lisesi kapatılmış ve Üsküdar 3. Erkek Ortaokulu ile birleştirilerek Karma Fıstıkağacı Ortaokulu adını almıştır.

Bu adla 1956-1957 eğitim ve öğretim yılına kadar gelinmiş, aynı yıl tekrar kız lisesine dönüştürülmüş ve yine Üsküdar Kız Lisesi adını almıştır.

2000-2001 eğitim ve öğretim yılında karma eğitime geçerek Üsküdar Lisesi adını alan okul, 2005-2006 eğitim ve öğretim yılında genel liseden Anadolu lisesine dönüştürülmüş yeni adı da İstanbul Üsküdar Lisesi olmuştur.

Öğrencilerini, sağlıklı iletişim kurabilen, millî ve manevi değerleri özümsemiş, özgüveni tam, sorumluluk alabilen, bilimsel ve analitik düşünceye sahip, teknolojiye hakim, üretken, araştırma yapmaya ve öğrenmeye meraklı, insana, topluma ve doğaya saygılı bireyler olarak yetiştiren okul, çok sayıda başarılı mezun vermiştir.