Okul, 1939 yılında eğitmen kursu olarak açılmış, 1940 Yılında Köy Enstitüsüne dönüştürülmüştür.

1951 yılına kadar yatılı-karma eğitim yapan enstitünün kız öğrencileri Kızılçullu Köy Enstitüsüne gönderilmiş, 1952-1953 eğitim ve öğretim yılında Kızılçullu Köy Enstitüsü kapatılınca kız öğrenciler yeniden Beşikdüzü Köy Enstitüsüne nakledilmiştir. Yatılı erkek öğrenciler ise farklı köy enstitülerine dağıtılarak okul, yalnızca kız öğrencilerin öğrenim gördüğü bir enstitüsü haline getirilmiştir.

1954 yılında öğretmen okulları ile ilköğretmen okulları birleştirilince Beşikdüzü Kız İlköğretmen Okulu adını almıştır. 1974-1975 eğitim ve öğretim yılından itibaren adı Beşikdüzü Kız Öğretmen Lisesi olarak değiştirilmiştir.

1983-1984 eğitim ve öğretim yılında öğretmen yetiştiren yükseköğretim kurumlarına öğrenci yetiştirmek amacıyla idari sistem yeniden düzenlenince, öğrencilere meslek dersleri okutulmaya başlanmıştır.

1989-1990 eğitim ve öğretim yılında okul, Anadolu Öğretmen Lisesi olmuş, 1995-1996 eğitim ve öğretim yılında Öğretmen Okulları lise son sınıftaki öğrencilerini mezun ederek tarihe karışmıştır.

1989-1990 öğretim yılından itibaren Beşikdüzü Anadolu Öğretmen Lisesi, bir yıl hazırlık + 3 yıl lise öğretimi olarak 4 yıl eğitim vermiştir.

Eğitimin lise türlerinde 4 yıla çıkarılmasıyla Beşikdüzü Anadolu Öğretmen Lisesinde eğitim ve öğretim hizmetleri 4 yıl olarak devam etmiştir. Günümüzde Fen Lisesi olarak hizmet veren okul, çok sayıda başarılı öğrenciler yetiştirmeye devam etmektedir.